在历史上,对基督徒的迫害可以追溯到公元一世纪至今(英语:Christianity in the 21st century)。自从基督教出现以来,基督教传教士和皈依基督教(英语:Conversion to Christianity)之人都成为受迫害的对象,他们有时甚至因信仰而殉道(英语:Christian martyr)。
在近代,部分在伊斯蘭教國家為主的基督徒的宗教自由及言論自由受到限制,部分更受到仇恨犯罪。
在晚清时期,流行着传教士挖取眼球、肾脏炼制药水等反教谣言。这是义和团参与者破坏教堂的原因之一。[1]
基督教在日本安土桃山时代、江户时代也曾遭受当局迫害,直至明治维新后才解禁。